隨機(jī)光學(xué)重建顯微鏡(stochastic optical reconstruction microscopy,簡(jiǎn)稱STORM),是一種超分辨率顯微鏡政供,其分辨率比傳統(tǒng)光學(xué)顯微鏡高10倍以上。
我們知道,光學(xué)顯微鏡憑借其非接觸遭歉、無(wú)損傷等優(yōu)點(diǎn),長(zhǎng)期以來(lái)是生物醫(yī)學(xué)研究的重要工具袖指。但由于光的衍射限制了光學(xué)顯微鏡的分辨率肪援,傳統(tǒng)的顯微鏡已經(jīng)不適于生命科學(xué)研究中的超微結(jié)構(gòu)成像了。本文將從原理熟什、應(yīng)用等方面對(duì)隨機(jī)光學(xué)重建顯微鏡STORM進(jìn)行相關(guān)研究堕义,若表述不正確或者不到位,請(qǐng)各位老師指正脆栋。
01光的衍射限制了光學(xué)顯微鏡的分辨率
在了解STORM之前倦卖,需要先知悉一個(gè)概念。眾所周知椿争,光學(xué)顯微鏡是用可見(jiàn)光來(lái)觀察生物樣品的糖耸。而光是一種橫波,當(dāng)它經(jīng)過(guò)一個(gè)圓孔丘薛,且這個(gè)圓孔的大小與光的波長(zhǎng)差別不大時(shí)嘉竟,光在此時(shí)不會(huì)沿直線傳播,而是在各個(gè)方向上“溜走”洋侨。 光在傳播過(guò)程中舍扰,遇到障礙物或小孔時(shí),光將偏離直線傳播的路徑而繞到障礙物后面?zhèn)鞑サ默F(xiàn)象希坚,這就叫 光的衍射 边苹。
由此而形成的圓孔衍射圖樣,叫“艾里斑”(圖1)裁僧。正因如此短琴,任何一種顯微鏡系統(tǒng)都無(wú)法把光線在像平面匯聚成無(wú)限小的點(diǎn),而是只能形成有限大小的艾里斑智榆。如果兩個(gè)點(diǎn)很接近膏般,像平面上的兩個(gè)艾里斑就幾乎重合在一起儿趋,那物平面上的兩個(gè)點(diǎn)就不可分辨了。
圖1娜珍、“艾里斑”概念圖
所以蛔乖,光的衍射使得光學(xué)顯微鏡的分辨率存在著極限(約為200 nm),使得傳統(tǒng)顯微鏡無(wú)法清晰觀察尺寸在200 nm以內(nèi)的生物結(jié)構(gòu),極大制約了生命科學(xué)研究的發(fā)展踏拓。
02超分辨率顯微鏡打破分辨率極限
科研工作者為了看到更精細(xì)的生命體精細(xì)結(jié)構(gòu)赃剂,就要想辦法突破這一成像障礙。為此韩烹,多種超分辨率顯微鏡被開(kāi)發(fā)了出來(lái)(超越了光學(xué)顯微鏡的分辨率極限淑停,故被稱為超分辨顯微鏡)。 在這里酿势,我們集中討論其中這樣一個(gè)具有相對(duì)優(yōu)勢(shì)的顯微鏡: 隨機(jī)光學(xué)重建顯微鏡STORM 锰抡。
在2006年的Nature上,莊小威與其它同事發(fā)現(xiàn)了一種能夠數(shù)百次反復(fù)在各種顏色的光照下使用且可在熒光態(tài)和暗態(tài)轉(zhuǎn)化的發(fā)光分子團(tuán)逢防,從而得到了一種比傳統(tǒng)光學(xué)顯微鏡高10倍以上分辨率的顯微技術(shù),并將其命名為隨機(jī)光學(xué)重建顯微鏡蒲讯,簡(jiǎn)稱STORM忘朝。
03隨機(jī)光學(xué)重建顯微鏡STORM技術(shù)原理簡(jiǎn)介
正如前面提到的那樣,兩個(gè)挨得很近的光點(diǎn)會(huì)讓我們分辨不出誰(shuí)是誰(shuí)判帮,那么如果我們分開(kāi)來(lái)看呢局嘁?
也就是說(shuō),當(dāng)我們照射并觀察第一個(gè)點(diǎn)時(shí)晦墙,第二個(gè)點(diǎn)并不會(huì)發(fā)光悦昵,自然不會(huì)產(chǎn)生艾里斑影響我們觀察第一個(gè)點(diǎn),前者艾里斑的中心點(diǎn)位置就是熒光分子的準(zhǔn)確位置晌畅。 接下來(lái)但指,通過(guò)某種方法,讓第二個(gè)點(diǎn)被照亮抗楔。這個(gè)時(shí)候第一個(gè)點(diǎn)又不在光斑的照明范圍之內(nèi)了棋凳,同樣不會(huì)干擾對(duì)第二個(gè)點(diǎn)的觀察。通過(guò)這種“以時(shí)間換空間”的設(shè)計(jì)连躏,巧妙地繞開(kāi)了阿貝極限(顯微鏡分辨極限)的束縛朵椿,將光學(xué)顯微鏡的分辨率大大提高。
STORM技術(shù)就運(yùn)用了這種思想怠义,它使用的是有機(jī)熒光分子對(duì)染料俭宁,并且通過(guò)一些方法使細(xì)胞內(nèi)的一小部分熒光分子發(fā)光,而不是全部陷母。這樣由于發(fā)光的點(diǎn)分布比較分散贷营,重疊比較少怯录,因此每個(gè)光暈可以近似為一個(gè)熒光分子。在一次激發(fā)中财调,可以確定一部分光暈的中心认吕,在下一次激發(fā)中,可以確定另外一部分光暈的中心兔触,把這許多次激發(fā)的結(jié)果疊加沼昵,就是完整而清晰的圖像。
STROM成像過(guò)程包含一系列圖像循環(huán)审炬。每個(gè)循環(huán)中极金,只打開(kāi)視野下一部分熒光基團(tuán),這樣每個(gè)活躍的熒光集團(tuán)都被分辨潮峦,它們的圖像與其他分子分開(kāi)囱皿,不重疊。這樣確定了基團(tuán)的準(zhǔn)確位置忱嘹,多次重復(fù)這個(gè)過(guò)程嘱腥,每次隨機(jī)打開(kāi)熒光基團(tuán)的不同亞基,得到圖像拘悦,確定每個(gè)亞基的位置后齿兔,把以上圖像重建成清晰的整個(gè)圖像。 理論上STORM可得到分辨率達(dá)到幾個(gè)納米的熒光圖像础米。
04隨機(jī)光學(xué)重建顯微鏡STORM技術(shù)應(yīng)用案例
隨機(jī)光學(xué)重建顯微鏡(STORM)是一種超分辨率顯微技術(shù)分苇,能夠在二維或三維、多種顏色下成像屁桑,甚至可以對(duì)活細(xì)胞成像医寿。這種成像技術(shù)的方法根據(jù)正在成像的內(nèi)容、如何成像以及正在產(chǎn)生的圖像類型而變化很大蘑斧,可以應(yīng)用于生命科學(xué)的許多領(lǐng)域靖秩,并為從神經(jīng)科學(xué)到亞細(xì)胞科學(xué)的許多不同需求提供非常高分辨率的圖像。自STORM技術(shù)被提起以來(lái)堡喳,越來(lái)越多的研究人員認(rèn)識(shí)到了這項(xiàng)技術(shù)的優(yōu)勢(shì)并廣泛運(yùn)用于研究中匣夭。
(以近些年的部分研究成果為例)
2013年,cell 雜志上的一篇研究報(bào)告:莊小威團(tuán)隊(duì)利用超分辨率熒光成像方法(STORM)對(duì)端粒 DNA 進(jìn)行原位成像勇湃,直接可視化染色質(zhì)中的 T 環(huán)結(jié)構(gòu)坝总,并系統(tǒng)地評(píng)估保護(hù)蛋白在 T 環(huán)形成中的作用。
圖3迅忙、STORM 成像顯示染色質(zhì)擴(kuò)散后的 T 環(huán)
2017年兆距,Liu Riyue團(tuán)隊(duì)開(kāi)發(fā)了一種光漂白的方法,以有效地降低藍(lán)藻和植物細(xì)胞的自身熒光并利用STORM技術(shù)在球形藍(lán)藻原綠球菌和開(kāi)花植物擬南芥中獲得了~10nm的橫向分辨率姆巨。
圖4乏尿、雙Z環(huán)的STORM圖像
2018年姐蝠,Lin, Danying團(tuán)隊(duì)提出了一種在固定樣本上采用Refresh熒光探針的方法,擴(kuò)展了多層 3D STORM的成像深度迂擅,并顯示了COS-7 細(xì)胞中微管幕柬、線粒體和內(nèi)質(zhì)網(wǎng)的三通道、擴(kuò)展深度 3D prSTORM圖像症丁。
圖5拆内、 COS-7 細(xì)胞中微管、線粒體和內(nèi)質(zhì)網(wǎng)的三通道宠默、擴(kuò)展深度 3D prSTORM 圖像
2019麸恍,Schlegel J , Peters S , Doose S 團(tuán)隊(duì)通過(guò)直接隨機(jī)光學(xué)重建顯微鏡(dSTORM)進(jìn)行超分辨率顯微鏡觀察,顯示腦膜炎球菌周圍有GM1聚集搀矫,突出了其對(duì)細(xì)菌侵襲的重要意義抹沪。
圖6、表達(dá)GFP的腦膜炎球菌(綠色)的GM1和Gb3的dSTORM圖像
2021瓤球,Hazime, K.S., Zhou, Z., Joachimiak團(tuán)隊(duì)運(yùn)用STORM技術(shù)發(fā)現(xiàn)融欧,表達(dá)IFT融合蛋白的細(xì)胞在纖毛基部,IFT亞基位于九個(gè)不同的位點(diǎn)卦羡,在它們進(jìn)入纖毛干之前噪馏,IFT蛋白以高親和力停靠在纖毛基部的9個(gè)位點(diǎn)虹茶。
圖7逝薪、IFT顆粒蛋白的定位隅要,N-或C-末端3HA標(biāo)記的IFT蛋白蝴罪、KIN1/KIF3A驅(qū)動(dòng)蛋白和銜接蛋白ODA16的頂視圖和側(cè)(側(cè))視圖的STORM圖像。
2021讥啤,Blandin, Anne-Florence團(tuán)隊(duì)利用球狀體膠質(zhì)瘤細(xì)胞擴(kuò)散的體外模型驱糜,發(fā)現(xiàn)α5整合素缺失的細(xì)胞比表達(dá)α5的細(xì)胞對(duì)TKIs更敏感。
圖8睬仿、吉非替尼處理的細(xì)胞的雙色dSTORM圖像顯示細(xì)胞外周和核內(nèi)體上的EGFR/β1整合素復(fù)合體
STORM因?yàn)槠鋬?yōu)異的單分子成像能力喧弦,越來(lái)越多的被用在細(xì)胞精細(xì)結(jié)構(gòu)的探索。對(duì)STORM的更多研究將提供更有效的方法來(lái)制備樣品和成像樣品竹小,以及提供更高分辨率的圖像吕迁。相信在未來(lái)這項(xiàng)技術(shù)能得到進(jìn)一步發(fā)展,變成功能更為強(qiáng)大的利器傲钳。
05超高分辨顯微成像系統(tǒng)iSTORM
現(xiàn)已發(fā)布的超高分辨率顯微成像系統(tǒng) iSTORM肿圾,成功實(shí)現(xiàn)了光學(xué)顯微鏡對(duì)衍射極限的突破,使得在 20 nm的分辨率尺度上從事生物大分子的單分子定位與計(jì)數(shù)棺昵、亞細(xì)胞及超分子結(jié)構(gòu)解析簇戳、生物大分子生物動(dòng)力學(xué)等的研究成為現(xiàn)實(shí)润申,從而給生命科學(xué)、醫(yī)學(xué)等領(lǐng)域帶來(lái)重大突破 樊展。
超高分辨率顯微成像系統(tǒng) iSTORM 具有 20 nm超高分辨率呻纹、3通道同時(shí)成像、3D同步拍攝专缠、實(shí)時(shí)重構(gòu)雷酪、2小時(shí)新手掌握 等特點(diǎn),已實(shí)現(xiàn)活細(xì)胞單分子定位與計(jì)數(shù)藤肢,并提供熒光染料選擇太闺、樣本制備、成像服務(wù)與實(shí)驗(yàn)方案整體解決方案嘁圈, 以納米級(jí)觀測(cè)精度省骂、高穩(wěn)定性、廣泛環(huán)境適用最住、快速成像钞澳、簡(jiǎn)易操作等優(yōu)異特性,獲得了高度認(rèn)可涨缚。
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