隨機(jī)光學(xué)重建顯微鏡(stochastic optical reconstruction microscopy娄帖,簡稱STORM)桑驱,是一種超分辨率顯微鏡,其分辨率比傳統(tǒng)光學(xué)顯微鏡高10倍以上。
我們知道,光學(xué)顯微鏡憑借其非接觸壤趴、無損傷等優(yōu)點,長期以來是生物醫(yī)學(xué)研究的重要工具瑞侮。但由于光的衍射限制了光學(xué)顯微鏡的分辨率的圆,傳統(tǒng)的顯微鏡已經(jīng)不適于生命科學(xué)研究中的超微結(jié)構(gòu)成像了。本文將從原理半火、應(yīng)用等方面對隨機(jī)光學(xué)重建顯微鏡STORM進(jìn)行相關(guān)研究越妈,歡迎各位老師討論交流。
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光的衍射
限制了光學(xué)顯微鏡的分辨率
在了解STORM之前钮糖,需要先知悉一個概念梅掠。眾所周知,光學(xué)顯微鏡是用可見光來觀察生物樣品的店归。而光是一種橫波阎抒,當(dāng)它經(jīng)過一個圓孔,且這個圓孔的大小與光的波長差別不大時消痛,光在此時不會沿直線傳播挠蛉,而是在各個方向上“溜走”。光在傳播過程中肄满,遇到障礙物或小孔時谴古,光將偏離直線傳播的路徑而繞到障礙物后面?zhèn)鞑サ默F(xiàn)象,這就叫光的衍射。
由此而形成的圓孔衍射圖樣,叫“艾里斑”(圖1)嘲陋。正因如此,任何一種顯微鏡系統(tǒng)都無法把光線在像平面匯聚成無限小的點效荷,而是只能形成有限大小的艾里斑。如果兩個點很接近喂搬,像平面上的兩個艾里斑就幾乎重合在一起密士,那物平面上的兩個點就不可分辨了。
圖1熙拐、“艾里斑”概念圖
所以孙般,光的衍射使得光學(xué)顯微鏡的分辨率存在著極限(約為200 nm),使得傳統(tǒng)顯微鏡無法清晰觀察尺寸在200 nm以內(nèi)的生物結(jié)構(gòu),極大制約了生命科學(xué)研究的發(fā)展搏翎。
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超分辨率顯微鏡
打破分辨率極限
科研工作者為了看到更精細(xì)的生命體精細(xì)結(jié)構(gòu)谊蚣,就要想辦法突破這一成像障礙。為此吸辽,多種超分辨率顯微鏡被開發(fā)了出來(超越了光學(xué)顯微鏡的分辨率極限职鸟,故被稱為超分辨顯微鏡)。在這里,我們集中討論其中這樣一個具有相對優(yōu)勢的顯微鏡:隨機(jī)光學(xué)重建顯微鏡STORM躏结。
在2006年的Nature上却盘,莊小威與其它同事發(fā)現(xiàn)了一種能夠數(shù)百次反復(fù)在各種顏色的光照下使用且可在熒光態(tài)和暗態(tài)轉(zhuǎn)化的發(fā)光分子團(tuán),從而得到了一種比傳統(tǒng)光學(xué)顯微鏡高10倍以上分辨率的顯微技術(shù)媳拴,并將其命名為隨機(jī)光學(xué)重建顯微鏡黄橘,簡稱STORM。
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隨機(jī)光學(xué)重建顯微鏡STORM
技術(shù)原理簡介
正如前面提到的那樣禀挫,兩個挨得很近的光點會讓我們分辨不出誰是誰旬陡,那么如果我們分開來看呢拓颓?
也就是說语婴,當(dāng)我們照射并觀察第一個點時,第二個點并不會發(fā)光驶睦,自然不會產(chǎn)生艾里斑影響我們觀察第一個點砰左,前者艾里斑的中心點位置就是熒光分子的準(zhǔn)確位置。接下來场航,通過某種方法缠导,讓第二個點被照亮。這個時候第一個點又不在光斑的照明范圍之內(nèi)了呼笨,同樣不會干擾對第二個點的觀察恋晃。通過這種“以時間換空間”的設(shè)計,巧妙地繞開了阿貝極限(顯微鏡分辨極限)的束縛肪吁,將光學(xué)顯微鏡的分辨率大大提高陷立。
STORM技術(shù)就運用了這種思想,它使用的是有機(jī)熒光分子對染料获踏,并且通過一些方法使細(xì)胞內(nèi)的一小部分熒光分子發(fā)光柱炼,而不是全部。這樣由于發(fā)光的點分布比較分散行贤,重疊比較少痒脊,因此每個光暈可以近似為一個熒光分子。在一次激發(fā)中播瓦,可以確定一部分光暈的中心驮觅,在下一次激發(fā)中,可以確定另外一部分光暈的中心众琼,把這許多次激發(fā)的結(jié)果疊加廓握,就是完整而清晰的圖像。
STROM成像過程包含一系列圖像循環(huán)嘁酿。每個循環(huán)中隙券,只打開視野下一部分熒光基團(tuán),這樣每個活躍的熒光集團(tuán)都被分辨,它們的圖像與其他分子分開娱仔,不重疊沐飘。這樣確定了基團(tuán)的準(zhǔn)確位置,多次重復(fù)這個過程牲迫,每次隨機(jī)打開熒光基團(tuán)的不同亞基耐朴,得到圖像,確定每個亞基的位置后盹憎,把以上圖像重建成清晰的整個圖像筛峭。理論上STORM可得到分辨率達(dá)到幾個納米的熒光圖像。
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隨機(jī)光學(xué)重建顯微鏡STORM
技術(shù)應(yīng)用案例
隨機(jī)光學(xué)重建顯微鏡(STORM)是一種超分辨率顯微技術(shù)陪每,能夠在二維或三維影晓、多種顏色下成像,甚至可以對活細(xì)胞成像檩禾。這種成像技術(shù)的方法根據(jù)正在成像的內(nèi)容捉瘟、如何成像以及正在產(chǎn)生的圖像類型而變化很大,可以應(yīng)用于生命科學(xué)的許多領(lǐng)域蔑誓,并為從神經(jīng)科學(xué)到亞細(xì)胞科學(xué)的許多不同需求提供非常高分辨率的圖像铲锭。自STORM技術(shù)被提起以來,越來越多的研究人員認(rèn)識到了這項技術(shù)的優(yōu)勢并廣泛運用于研究中誉梳。
(以近些年的部分研究成果為例)
2013年欲华,cell 雜志上的一篇研究報告:莊小威團(tuán)隊利用超分辨率熒光成像方法(STORM)對端粒 DNA 進(jìn)行原位成像,直接可視化染色質(zhì)中的 T 環(huán)結(jié)構(gòu)骇俏,并系統(tǒng)地評估保護(hù)蛋白在 T 環(huán)形成中的作用天殉。(點此查看原文)
圖3、STORM 成像顯示染色質(zhì)擴(kuò)散后的 T 環(huán)
2017年用牲,Liu Riyue團(tuán)隊開發(fā)了一種光漂白的方法塌纯,以有效地降低藍(lán)藻和植物細(xì)胞的自身熒光并利用STORM技術(shù)在球形藍(lán)藻原綠球菌和開花植物擬南芥中獲得了~10nm的橫向分辨率。(點此查看原文)

圖4勋酿、雙Z環(huán)的STORM圖像
2018年隆肪,Lin, Danying團(tuán)隊提出了一種在固定樣本上采用Refresh熒光探針的方法,擴(kuò)展了多層 3D STORM的成像深度博个,并顯示了COS-7 細(xì)胞中微管怀樟、線粒體和內(nèi)質(zhì)網(wǎng)的三通道、擴(kuò)展深度 3D prSTORM圖像盆佣。(點此查看原文)

圖5往堡、 COS-7 細(xì)胞中微管、線粒體和內(nèi)質(zhì)網(wǎng)的三通道共耍、擴(kuò)展深度 3D prSTORM 圖像
2019虑灰,Schlegel J , Peters S , Doose S 團(tuán)隊通過直接隨機(jī)光學(xué)重建顯微鏡(dSTORM)進(jìn)行超分辨率顯微鏡觀察吨瞎,顯示腦膜炎球菌周圍有GM1聚集,突出了其對細(xì)菌侵襲的重要意義穆咐。(點此查看原文)

圖6颤诀、表達(dá)GFP的腦膜炎球菌(綠色)的GM1和Gb3的dSTORM圖像
2021,Hazime, K.S., Zhou, Z., Joachimiak團(tuán)隊運用STORM技術(shù)發(fā)現(xiàn)对湃,表達(dá)IFT融合蛋白的細(xì)胞在纖毛基部崖叫,IFT亞基位于九個不同的位點,在它們進(jìn)入纖毛干之前拍柒,IFT蛋白以高親和力托目靠在纖毛基部的9個位點。(點此查看原文)
色)的GM1和Gb3的dSTORM圖像
2021柔朽,Hazime, K.S., Zhou, Z., Joachimiak團(tuán)隊運用STORM技術(shù)發(fā)現(xiàn)垂暖,表達(dá)IFT融合蛋白的細(xì)胞在纖毛基部,IFT亞基位于九個不同的位點墅失,在它們進(jìn)入纖毛干之前鼻御,IFT蛋白以高親和力徒液洌靠在纖毛基部的9個位點筑渴。(點此查看原文)

圖7、IFT顆粒蛋白的定位少炎,N-或C-末端3HA標(biāo)記的IFT蛋白磕阱、KIN1/KIF3A驅(qū)動蛋白和銜接蛋白ODA16的頂視圖和側(cè)(側(cè))視圖的STORM圖像。
2021峡审,Blandin, Anne-Florence團(tuán)隊利用球狀體膠質(zhì)瘤細(xì)胞擴(kuò)散的體外模型情澈,發(fā)現(xiàn)α5整合素缺失的細(xì)胞比表達(dá)α5的細(xì)胞對TKIs更敏感。(點此查看原文)

圖8拨聚、吉非替尼處理的細(xì)胞的雙色dSTORM圖像顯示細(xì)胞外周和核內(nèi)體上的EGFR/β1整合素復(fù)合體
STORM因為其優(yōu)異的單分子成像能力瘤琐,越來越多的被用在細(xì)胞精細(xì)結(jié)構(gòu)的探索。對STORM的更多研究將提供更有效的方法來制備樣品和成像樣品丑瞧,以及提供更高分辨率的圖像柑土。相信在未來這項技術(shù)能得到進(jìn)一步發(fā)展,變成功能更為強大的利器绊汹。